Cadnano - simulátor DNA struktur ve 2D i 3D Funguje na počítači

Aplikace umožní grafický návrh struktur DNA pro vytvoření nano-softbotů ke studiu chování DNA struktur. Může tak pomoct nejen při studiu genetiky. Pracuje ve 2D i 3D modelech.

Už z názvu programu by se dalo odhadnout, k čemu slouží. CAD aplikace chápeme pro návrh nějakých konstrukcí a slovíčko nano dává tušit, že půjde o něco velmi malého. Opravdu, Cadnano je program ke konstrukci nano struktur, konkrétně DNA. Lze pomocí něj poměrně jednoduchou cestou sestavit tzv. DNA origami, které simuluje struktury DNA, tedy jejich molekuly. K pochopení aplikace je však třeba se orientovat v problematice genetiky. Jedno je však jasné, Cadnano je unikátní open source nástroj pro zkoumání, modelování a pozorování chování DNA struktur. Aplikace je využita například pro konstrukce nano-softbotů k opravám v lidském těle. Pro ty, kteří se vyznají v problematice, dodávám, že aplikace podporuje tzv. scaffold modelování k vytvoření struktur. 3D vizualizace jsou stavěny jako v komerčním softwaru Maya 3D. Cadnano taktéž pomůže pochopit souvislosti mezi biologií a genetickými algoritmy, které jsou motivovány DNA operacemi, jako je delece, křížení, apod.

Cadnano přináší:

  • unikátní 2D/3D modelovací nástroj DNA struktur
  • výbornou studijní aplikaci k pochopení genetiky a genetického programování
  • podpora scaffold modelů, 3D výstupů
  • open-source MIT licence, dostupnost pro Windows, Linux i MacOS
  • modulární architektura k vytvoření vlastních doplňků
  • 3D modely vyžadují instalaci Maya 3D, studentská verze je zdarma

Cadnano je ve svém oboru špičkovým softwarem s ohledem na cenu. Umožní 2D/3D simulace DNA struktur a předčí v něčem i například komerční MATLAB s Bioinformatics Toolboxem. Přestože aplikace nebude asi na většině počítačů uživatelů, nepředstavit ji jako (nejen) skvělou pomůcku k výuce genetiky a algoritmů, by byla škoda. Využití vidím zejména v modelování DNA a lepšímu pochopení genetiky, především přínos v lékařství. Nedávno byla aplikace využita k simulace DNA origami struktur pro léčbu rakoviny.

Stáhnout Cadnano (29,7 MB) - Win 2000, Win XP, Win Vista, Win 7, Linux, Mac OS, Win 8 - 32-bit verze pro Windows


12345 (5 = nejlepší) Ohodnoťte Cadnano

Líbí se vám Cadnano? :
Operační systém: Win 2000, Win XP, Win Vista, Win 7, Linux, Mac OS, Win 8
Jazyk: Anglický
Instaluje se: Ano
Jednoduchá instalace: Ano

Kód pro sdílení článku: (zobrazit »)

Odkaz:

HTML kód:

Kód do fóra:

Počet komentářů: 0 (Ukaž komentáře) | Přidat komentář |
|
Informační e-mailDoporučit článek kamarádovi / kamarádce (e-mailem)

MP3: Vivaldi , Jaromír Nohavica MP3
Programy: AVG zdarma , avast! Free Antivirus , OpenOffice.org , CCleaner, KMPlayer
Video: Vyprávěj , iVysílání
Ostatní: Seriály online , Online disk Dropbox s 500 MB bonusem.